El Fondo para la Excelencia de la Educación y la Investigación (FEEI) asignó, desde sus inicios en setiembre de 2012 hasta junio de 2019, el 93% del total de los recursos recibidos a los programas y proyectos propuestos y ejecutados por el Ministerio de Educación y Ciencias (MEC), Consejo Nacional de Ciencias y Tecnología (CONACYT), Agencia Nacional de Evaluación y Acreditación de la Educación Superior (ANEAES) y el Ministerio de Hacienda. En dicho periodo, se recibieron más G. 3,6 billones y se ha asignado más de G. 3,3 billones.

El Consejo de Administración del FEEI es la instancia responsable de la gestión de los recursos destinados al Fondo para la Excelencia. Está presidido por el ministro de Hacienda, Benigno López, y compuesto por el titular de la Secretaría Técnica de Planificación, Carlos Pereira; el ministro de Educación, Eduardo Petta; el ministro de Salud, Julio Mazzoleni; y el titular de CONACYT, Carlos Alberto Lima. Además, el Consejo está integrado por cuatro miembros de la sociedad civil.

Entre el 2012 y junio de 2019, los organismos responsables ejecutaron más de 1,4 billones de guaraníes en programas y proyectos para mejorar la calidad de la educación y promover la investigación científica. La duración de algunos de los mismos se extiende incluso hasta el 2023.

A la fecha, son 15 los programas y proyectos que se ejecutan con fondos del FEEI.  La mayor proporción de los recursos se destina al Ministerio de Educación y Ciencias, al cual se asignó más de G. 2 billones como responsable de 11 iniciativas, seguido del Ministerio de Hacienda, con aproximadamente G. 588.000 millones, CONACYT, G. 580.000 millones y ANEAES con G. 23.000 millones.

En este sentido, a junio de 2019, la ANEAES presenta un nivel de ejecución de sus programas y proyectos del 76%, el Ministerio de Hacienda, del 75% y el CONACYT del 72%, mientras que los porcentajes del MEC son del 40%, según los montos totales presupuestados.

Existen, además, dos programas que ya han culminado su ejecución: la primera fase del programa de atención a la primera infancia y el de evaluación de logros académicos a estudiantes, ambos implementadas por el MEC.

Cabe recordar que los recursos recibidos por el FEEI están blindados, esto permite asegurar que el dinero esté disponible para ejecutarse únicamente en las áreas de inversión previstas en la ley de creación, N° 4758/2012.